MU OmicsLab е научна единица в рамките на Секция „Токсикология“ към Фармацевтичния факултет, МУ–София, ръководена от проф. Вирджиния Цанкова.
Единицата комбинира изчислителен анализ със силна експертиза в експерименталната токсикология (ин витро и ин виво), което позволява интегрирани проекти, съвместно менторство и реалистични планове за валидация.

Ръководител (MU OmicsLab)

доц. Йордан Йорданов
Секция „Токсикология“
Катедра „Фармакология, фармакотерапия и токсикология“
Фармацевтичен факултет, Научноизследователски институт по иновативна медицинска наука (InnoMedSci), направление „Изкуствен интелект в здравеопазването“, Медицински университет – София

Доц. д-р Йордан Йорданов е магистър-фармацевт и доктор по токсикология от Медицински университет – София. Ранните му изследвания са фокусирани върху ин витро токсикологията на различни вещества, включително наночастици за лекарствено доставяне и въздушни частици/аерозоли. Понастоящем преподава Токсикология и Фармакология на студенти по фармация в МУ–София.

С течение на времето научните му интереси се развиват към омикс-ориентирана биоинформатика и изчислителна токсикология, с цел свързване на ин витро фенотипи с биологични механизми и предиктивно моделиране. MU OmicsLab поставя приоритет върху интерпретация на транскриптомика/RNA-seq, интегративни омикс подходи и възпроизводими биоинформатични пайплайни, допълнени от стратегии, информирани от данни (вкл. машинно обучение) за оценка на риска и механистична обосновка.

Основен фокус: омикс и биоинформатика

  • Интегративен анализ: свързване на молекулярни показатели с фенотипи (жизнеспособност, оксидативен стрес, функционални маркери)
  • Транскриптомика / RNA-seq: QC → диференциална експресия → анализ на пътища/профили → механистична интерпретация → причинност
  • Изчислителна токсикология: механистично ориентирана интерпретация, структуриране на доказателства, докладване, оценка на риска
  • Методи, информирани от данни: ML-подпомогнато откриване на закономерности и предиктивно моделиране (където е приложимо)

Вторичен фокус: анализ на изображения (подкрепящ капацитет)

  • Алгоритми за количествени анализи на микрографии в експерименталната токсикология
  • Възпроизводим скоринг и документация
  • ML-подпомогната сегментация/фенотипизиране при необходимост за омикс-свързани хипотези

Международни колаборации (избрани)

Научният му опит включва международни колаборации, включително:

  • Биоинформатично ориентирано сътрудничество с д-р Томас Мор (Медицински университет – Виена, Университет Виена; ScienceConsult - DI Thomas Mohr KG), подпомагащо стратегията за анализ, възпроизводими пайплайни и инфраструктурно изграждане
  • OpenTox и Edelweiss Connect (Швейцария): сътрудничество с Barry Hardy и Asmaa Ali (Edelweiss Connect GmbH, Базел), в синхрон с мисията на OpenTox за развитие на данно-ориентирана токсикология, прозрачни работни процеси за оценка на риска и интероперабилни ресурси за знания
  • Медицински университет – Грац (Австрия): сътрудничество с фокус върху концепции и стратегии за оценка при siRNA терапевтици
  • Университет Сиена (Италия): ин витро токсикология и дългогодишни връзки за съвместна работа

Научни мрежи (COST Actions)

Участва в COST Actions, включително:

  • CardioPharmaGENET
  • STRATAGEM
  • Precision-BTC-Network

В рамките на тези мрежи интересите му са насочени към данно-ориентирани стратегии за оценка на риска, изчислителна подкрепа при интерпретация и транслационен прочит на фармакологични и токсикологични доказателства.

Основна роля в MU OmicsLab: стратегия за омикс/биоинформатика, интерпретация на RNA-seq, изчислителна токсикология, възпроизводими работни процеси, менторство и изграждане на колаборации.

Вътрешни експерти и консултанти (Секция „Токсикология“, МУ–София)

Работата на MU OmicsLab разчита на тясното сътрудничество с вътрешни експерти в експериментална токсикология, нанотоксикология, лекарствена безопасност и токсикологично обучение/менторство. Те предоставят научни консултации, обратна връзка за експериментален дизайн и съвместно ръководство.

проф. Вирджиния Цанкова (токсикология и лекарствена безопасност; ERT)

Проф. Цанкова е възпитаник на Фармацевтичния факултет (МУ–София) и работи в Катедра „Фармакология, фармакотерапия и токсикология“ от 1991 г. Притежава специалности „Клинична фармация“ и „Токсикология и токсикологичен анализ“ (МУ–София) и е Европейски регистриран токсиколог (ERT) (от 2010 г.).

Експертиза: експериментална токсикология, нанотоксикология, лекарствена безопасност, предклинична токсикология; преподавателска и научна дейност с опит в ръководството на докторантури (вкл. токсикология/нанотоксикология).

Академичен профил (избрано):

  • Преподаване в дисциплини по токсикология и фармакология (вкл. лекарствена безопасност, лекарствен метаболизъм, токсикологична химия, наркомании).
  • Ръководни и експертни роли, включително етични/качествени комисии.
  • Публикационна и проектна активност, включваща национални и международни партньорства (вкл. COST и колаборации с Италия).

проф. Магдалена Кондева-Бурдина (лекарствена токсикология, екотоксикология; ERT)

Проф. Кондева-Бурдина е възпитаник на Фармацевтичния факултет (МУ–София) и е част от Катедрата от 2003 г. Притежава специалност „Токсикология и токсикологичен анализ“ (МУ–София) и е Европейски регистриран токсиколог (ERT) (от 2015 г.).

Експертиза: експериментална токсикология, лекарствена токсикология, екотоксикология, лекарствени взаимодействия, природни токсини; участие в професионални токсикологични организации.

Академичен профил (избрано):

  • Преподаване и научно ръководство в токсикология, токсикологична химия, лекарствен метаболизъм и др.
  • Публикационна активност, цитируемост и участие в национални и индустриални проекти.

доц. Деница Стефанова (ин витро модели, нанотоксикология, протективни механизми)

Доц. д-р Стефанова е възпитаник на Фармацевтичния факултет (МУ–София) и има международен обучителен опит, включително обмен и програми като Erasmus (вкл. Сиена, Италия). Работи в Катедрата от 2015 г. и притежава специалност „Токсикология и токсикологичен анализ“.

Експертиза и научни интереси: ин витро токсикологично охарактеризиране на синтетични/природни вещества и наносистеми за доставяне; ин витро/ин виво моделиране на патологични увреждания (вкл. невродегенерация, хепатотоксичност, диабет и др.); протективни ефекти и механизми на детоксикация; лекарствен метаболизъм и токсичност.

Присъединете се като студент или докторант

Очакваме:

  • студенти за дипломни работи (биоинформатика, RNA-seq, анализ на изображения)
  • докторанти (изчислителна токсикология, омикс интеграция, възпроизводими пайплайни)
  • възможни са модели на съвместно ръководство с външни лаборатории

Ако търсите тема, изпратете кратко съобщение за Вашия опит и интереси.
→ contact us · свържете се с нас