Изчислителна инфраструктура
Нашата лаборатория поддържа изчислителни ресурси с висок капацитет за биоинформатични изследвания и анализ на данни.
Налични ресурси
- Специализирани изчислителни сървъри
- Биоинформатичен софтуер и инструменти
- Системи за съхранение и управление на данни
- Обучение и документация
Отворен софтуер
- PhaseContrastNeuriteAnalyzer: браузърно насочван работен процес за анализ на неврити във фазово-контрастни микроскопски изображения, комбиниращ Fiji/ImageJ предварителна обработка, ilastik пикселна класификация и R-базиран анализ.
- RNA_Hypothesis_Workbench: изследователска среда за RNA-насочено формулиране на хипотези и изчислително изследване.
Отворени набори от данни
- Yordanov Y, Hristova S. Phase-contrast microscopy dataset for morphological evaluation of the differentiation status of SH-SY5Y cells upon rosmarinic and retinoic acid treatments. Zenodo. DOI: 10.5281/zenodo.19634700.
Достъп
Ресурсите са достъпни за членове на лабораторията и оторизирани партньори. Моля, свържете се с нас за информация относно достъп.