Публикувана е beta версия на AOPxGeneNet в рамките на колаборация, развила се от OpenTox общността.
Голямо предизвикателство в транскриптомиката е преминаването от дълги списъци с диференциално експресирани гени към биологично и токсикологично интерпретируеми механизми. AOPxGeneNet адресира този проблем чрез свързване на генни коекспресионни мрежи и молекулни сигнали на пертурбация с рамката Adverse Outcome Pathway (AOP).
Подходът осигурява път от молекулни сигнатури към Key Events и Adverse Outcomes, като съчетава информация за промени в експресията, мрежова структура и механистично знание.
MU OmicsLab допринася към това колаборативно изследователско направление заедно с Barry Hardy, Asmaa A. Abdelwahab и Thomas Mohr. Работата се вписва пряко в по-широкия ни интерес към използването на мрежова биология, транскриптомика и изчислителна токсикология за превръщане на високомерни молекулни данни в проверими механистични хипотези.
Свързани материали