Добре дошли в MU OmicsLab
Лаборатория по изчислителна токсикология и омикс изследвания
MU OmicsLab развива изчислителна токсикология и омикс работни процеси за превръщане на експериментални, молекулни и получени от изображения данни в интерпретируеми биомедицински хипотези.
Лабораторията свързва експерименталната токсикология с биоинформатика, анализ, подпомаган от изкуствен интелект, и възпроизводими работни процеси — от клетъчни модели до интерпретация на омикс данни и изчислителна токсикология.
- MU OmicsLab работи в рамките на Секция „Токсикология“ към Катедра „Фармакология, фармакотерапия и токсикология“, Фармацевтичен факултет, Медицински университет – София.
- MU OmicsLab към момента е малка научна единица и активно изгражда капацитет чрез съвместно ръководство на дипломни и докторски работи, колаборации и споделена инфраструктура.
- Интересувате се от сътрудничество или да се присъедините към нашия екип? Моля свържете се с нас.
Дейност
- Изчислителна токсикология: механистично ориентирана интерпретация на токсикологични ефекти чрез мулти-омикс и структурирани данни.
- Биоинформатика: RNA-seq и транскриптомика; анализ на биологични пътища и пертурбационни профили; интегративна интерпретация.
- RNA терапевтици и доставяне (компютърна подкрепа): логика на дизайна на RNA конструкции и стратегии за оценка, съобразени с клетъчни пътища.
- Анализ на изображения: работни алгоритми за количествени анализи на микрографии и ML-подпомогната сегментация/фенотипизиране.
- ИИ за биомедицинска подкрепа при вземане на решения: безопасни, прозрачни прототипи за обобщаване и контекстуална интерпретация (за научни цели).
Разгледайте
Ключови думи: изчислителна токсикология · биоинформатика · транскриптомика · анализ на изображения · възпроизводими изследвания · ИИ/ML
Развитие на мултиомикс капацитет чрез Erasmus+ обучение в Университета Виена
Доц. д-р Йордан Йорданов проведе практическо Erasmus+ обучение по нетаргетна масспектрометрична протеомика в Gerner Lab, Университет Виена.
От магистърски изследователски въпрос до възпроизводим open-science работен процес
Нова статия в Pharmacia свързва SH-SY5Y невритна морфология, PhaseContrastNeuriteAnalyzer, отворен код и FAIR-ориентиран микроскопски набор от данни.
Изкуствен интелект в анализа на биомедицински данни в INGENIUM Blended Intensive Programme
Доц. д-р Йордан Йорданов изнесе лекция за изкуствения интелект в анализа на биомедицински данни в рамките на INGENIUM Blended Intensive Programme в МУ - София.
Колко безопасни са лекарствата, които приемаме?
Доц. д-р Йордан Йорданов гостува в българския научен подкаст ‘Ти и науката’ с разговор за лекарствата, баланса полза-риск и предклиничната безопасност.
Участие в OpenTox 2026 стажантската програма
MU OmicsLab предложи супервизия на стажантски теми в OpenTox 2026 Summer/Autumn Internship Programme в областта на AI, токсикологията и биомедицинските данни.
MU OmicsLab на първата годишна среща на CardioPharmaGENET в Дармщат
Доц. д-р Йордан Йорданов представи Медицински университет - София на първата годишна среща на CardioPharmaGENET в Дармщат.
Публикувани са PhaseContrastNeuriteAnalyzer и отворен микроскопски набор от данни
PhaseContrastNeuriteAnalyzer беше публикуван заедно с 5.8-GB отворен микроскопски набор от данни за възпроизводим анализ на SH-SY5Y невритна морфология.
AOPxGeneNet beta свързва транскриптомни мрежи с Adverse Outcome Pathways
Публикувана е beta версия на AOPxGeneNet, насочена към свързване на транскриптомен мрежов анализ с рамката на Adverse Outcome Pathways.
Студентски магистърски проект за SH-SY5Y диференциация получи признание
Студентска магистърска теза върху ефектите на розмаринова и ретиноева киселина в SH-SY5Y клетки получи признание и по-късно стана част от по-широка open-science изследователска линия.
Интегриране на коекспресионни мрежи с Adverse Outcome Pathways при болестта на Parkinson
Доц. д-р Йордан Йорданов представи работа на OmicsLab върху WGCNA, AOPs и болестта на Parkinson на OpenTox Virtual Conference 2025.